第45話「天国への階段 」

STAIRWAY TO HEAVEN

飼い犬を思わぬことから失ってしまったラムジーは、すっかり落ちこんでいた。そこへバックステップの指令が下る。貨物列車が脱線、積載していた核廃棄物がコロラド川を汚染してしまったのだ。廃棄物の影響で、バックステップは危険だというバラード博士の忠告を無視してパーカーは、過去へ戻ろうとするが？！

第46話「ＰＫＯの勇士」

PEACEKEEPERS

紛争が続くボスニアヘルツェゴビナ。国連平和維持活動（PKO）に参加中の米国衛生兵カーターは、移動病院で難民の少女を治療した礼に、少女の祖父から、ある地図をもらいうける。ところが、その小さな出来事から事態は思わぬ展開、結果として戦火が広がりバックステップ指令が発動されるのだが？！

第47話「ライノ」

RHINO

コロンビアで米海軍のユニットが麻薬輸送団を捕まえるが、麻薬カルテルに皆殺しにされる。オルガはバックステップではなく、まずワシントンに出向き、コロンビアの大統領エストランダに面会を求める。ところが、“セイディ”という刺客が大統領を暗殺。コロンビア大統領を救うためバックステップの指令が下る。

第48話「死を招くドラゴン」

THE DUNWYCH MADNESS

パーカーは旧友のクープを訪ねにメーン州のある村を訪れる。クープは奇妙なメッセージを送ってきていた。パーカーが村に着くとそこは悪夢に溢れ、村人の誰かが村そのものを吹き飛ばそうとしていた！どうやら漁業網に昔の実験円筒団がが引き上げられことがきっかけとなっているらしい。爆発を逃れたパーカーはバックステップで真相を探る。

第49話「オルガの休暇」

OLGA'S EXCELLENT VACATION

オルガは自分のみたパーカーがでてくるセクシーな夢に悩まされ、バックパックでアラスカへと旅にでる。一方、レイリーという韓国に雇われた男がアラスカ・パイプラインの爆破を計画。オルガの参加したハイカーのグループのうちの1人がスパイで、パイプラインは爆破され、オルガも死んでしまう。パーカーはバックステップでオルガを救いに向かう。

第50話「デロリス・ゲーム」

DELORIS DEMANDS

デロリスと名乗る謎めいた電話をうけるバックステップチーム。パーカーが彼女を無視しつづければ飛行機を墜落させるというのだ。そしてデロリスはパーカーの声とNSAコードを盗み、エア・トラフィック・コントロール・システムをシャットダウン、何十もの航空機が墜落してしまう。デロリスはNSAがバックステップ指令を下さない限り、飛行機を墜落させつづけるという。

第51話「幻からの脱出」

THE FIRE LAST TIME

熱心な宗教家ワトソンが同志の復讐のため、監獄から脱出、司法長官殺害する。NSAはワトソンが犯人であることを知り、パーカーにバックステップで、ワトソンが脱出するときに乗っていた護送バスのルート変更を命ずる。ところがバックステップしたパーカーにソマリアでの悪夢が甦ってきて…。

第52話「復讐者」

Tracker

かつて首都ワシントンで米国とロシアの大統領暗殺を企てたカール・プレツィネフは、パーカーに殺された。カールの弟ヨセフ・プレツィネフは復讐を誓ってフランク・パーカーを探す。

第53話「束の間の栄光」

Top Dog

タルマッジが倒れ、ラムジーが長官代理に任命される。権力を手にしたラムジーは、ドノヴァンをメインの時空飛行士に置き、パーカーを追い出すべく次の候補者を探し始める。

第54話「新アダムとイブ」

Adam & Eve & Adam

パーカーとオルガ、アウズレーはジョーンズ少佐の案内で、陸軍施設の地下180メートルにある金庫室へ入るが、その直後にロスアラモスで行われた新型兵器の実験の影響で、地上の全生物が消滅してしまう。

第55話「女精神科医」

Head Case

マクスウェル大統領は精神科医のグレースに、エスカランテ将軍を抹殺しなければならないと打ち明ける。エスカランテは人権を無視した独裁者で、ラテン・アメリカ全土に麻薬カルテルを広げようとしていた。だがそのことを聞きつけたエスカランテは「世界に公表されたくなければ、自分と手を結べ」と大統領を脅迫する。

第56話「美しき泥棒」

Raven

イギリスのロンドン。シンプソンテクノロジー社に忍び込んだ泥棒レイバンは、電子回路を盗み出すが仲間に撃ち殺される。数日後、米国ニューメキシコ州にあるホワイトサンズ実験場で新型ミサイルのテストが行われたが、ミサイルは実験場を誤爆し陸軍の幹部が犠牲になった。何者かがレイバンが盗んだ電子回路を悪用してミサイルのプログラムを変更した事が判明し、バックステップ指令が下る。

第57話「大統領の娘」

The First Freshman

マクスウェル大統領の娘で19歳のDDは奔放な生活が災いして大統領から謹慎を言い渡される。抜け出してボーイフレンドとパーティーへいくDDだったが彼が自分に近づいたのは出世目当てだと知り、会場を飛び出したところ事故死する。悲しみに打ちひしがれた大統領は公務もこなせず、その間に世界各地でテロや暴動が起きる。DDの死が事故なのか他殺なのか分からぬまま、パーカーはバックステップする

第58話「黙示録の始まり」

Revelation

ノーベル平和賞を受賞した宗教家アズィズ氏の呼びかけで、各国の首脳がワシントンに集まり和平会議が開かれることになった。そんな時7年後の世界からバックステップして来た時空飛行士マグラスが、タルマッジに連絡して来た。マグラスの任務はアズィズ氏を暗殺して第3次世界大戦を防ぐことだった。NSA本部はアズィズ氏の暗殺を決定し、パーカーが狙撃を命じられる。

第59話「異星人のフェロモン」

Crystal Blue Persuasion

宇宙船USSヤンキー号が謎の宇宙船にドッキング。船長のシュトレックと2人のクルーが乗り移る。しかし突然宇宙船は爆発、シュトレックだけが生き延びるが宇宙船内での記憶はなかった。謎を解明するため、シュトレックがバックステップ基地へ来る。メントナーとアウズレーはその解読にかかるが、帰還後、シュトレックと出会った女性はなぜか皆が皆我を忘れて彼におぼれた。オルガまでもが…。

第60話「超能力少女モリー」

Empty Quiver

首都ワシントンが核爆発で壊滅、バックステップ指令が下るが、パーカーが吐き出したお茶が制御装置にかかり故障、カプセルは無人のまま発進する。7日前のワシントン郊外に無人のカプセルが出現するが、どんな任務か分からない。メントナーは9才の少女モリーの千里眼を使って惨事を防ごうとするが…。

第61話「ミラーワールド」

Kansas

サラとスティーヴはネバーランドの中に異星人がいると信じ、それを暴露すべくネバーランドに侵入する。その頃パーカーはカプセルに乗って実験をしていたが、スティーヴが途中で電源を切ったためカプセルが異状発進。激しい振動が収まりパーカーがカプセルを降りると、外の様子はがらりと変っていた…。

第62話「ファイナル・カウントダウン」

The Final Countdown

アジア某国でICBMが発射されたため、米軍司令部からミサイル発射準備の緊急指令が届く。その直後に司令部は全基地へ中止命令を送るが、指令を受信できなかったウォレン基地が核ミサイルを発射したせいで核戦争が勃発し、アメリカの西半分が壊滅してしまう。バックステップ指令が下るが、NSA本部へ出頭しているパーカーの替わりにドノヴァンがカプセルに搭乗することとなる。

第63話「悪魔の占星術」

The Brink

以前パーカーがいたハンセン島から出てきたハロルドが、プレアデス星団を通った流星群を見て、コンサート会場でレーザーを照射、大勢の死傷者を出す。それを阻止するためパーカーにバックステップ指令が下る。

第64話「炎の少年」

Sugar Mountain

空港で爆発事故が起こり、テロリストのシーザーらがCIAの新型兵器を盗み出し爆発事故を起こしたと判明。バックステップしたパーカーは、シーザーが少年テーラーを連れているのに気づく。テーラーは物体の温度を上昇させる念力を持つ超能力者で、CIAから盗まれた新兵器とはこの子だったのだ。CIAがテーラー抹殺指令を出したと知ったパーカーは命がけでテーラーを守る。

第65話「バック・ステップ・イン・ロシア」

Born in the USSR

オルガの故郷であるロシアのヴィヤトカ付近を通った軍用列車から毒ガスが漏れ、5万人のロシア人が犠牲になる。だが国家安全に関わる問題ではないと言う理由でバックステップは見送られる。心を痛めていたオルガのもとへ昔の恋人セルゲイから電話が入る。この事件で家族を失ったと言い、ロシアで共にタイムトラベルの研究をしていたミーシャに引き合わせる。オルガはミーシャに異星船の秘密を教えてしまうが、実はロシアの政権を奪おうというソブチャック将軍の罠であり、セルゲイは将軍の腹心の部下だったのだ。

第66話「無実の死刑囚」 （最終回）

Live: From Death Row

1997年、レストランの経営者ジョニーは、実業家タイラーの策略で濡れ衣を着せられ殺人犯として逮捕されてしまう。そしてジョニーは死刑を執行されてしまうが、６日後ジョニーの無実が証明される。シールズ時代の仲間ジョニーを救うため、パーカーは統合参謀本部マスターソン将軍の事故死を防ぐとタルマッジを説得してバックステップする。