ベンジャミン・シスコ司令官
Capt. Benjamin Sisko
地球人。DS9の司令官。
惑星連邦宇宙艦隊大佐。宇宙艦隊初の試作戦艦U.S.S.ディファイアントの艦長も兼任。
常に沈着冷静で、融通が利かないという一面も。
ピカード艦長が誘拐されたボーグ第1次太陽系侵攻の際、妻を失っている。
エイヴリー・ブルックス Avery Brooks
キラ・ネリス
Major/Colonel Kira Nerys
ベイジョー人。DS9の司令官。ベイジョー防衛軍少佐。
連邦との連絡員でDS9副長も兼ね、ベイジョーと連邦の板挟みとなることも。
勝気な性格で過激な行動も多い。当初は惑星連邦とシスコに反抗的であったが、次第にシスコを信頼するようになる。
かつては対カーデシア反乱時の英雄。
ナナ・ヴィジター Nana Visitor
ジャッジア・ダックス
Jadzia Dax
DS9科学士官で宇宙艦隊少佐。
300歳を越す共生生命体ダックスを体に宿すトリル人女性。
共生生命体とホスト（母体）は人格や記憶を共有し、ホストの寿命が尽きると記憶や人格と共に新しいホストに移る。ジャッジアは7人目のホスト。一人前のホスト・クルゾンは年配の男性でシスコの友人だった。
ウォーフに恋心を抱くようになる。
テリー・ファレル Terry Farrell
ウォーフ
Lt. Commander Worf
クリンゴン帝国との連邦側の和平調停役で宇宙艦隊少佐。
元U.S.S.エンタープライズD号保安主任。2372年より戦略指揮官としてDS9へ転属、U.S.S.ディファイアントの艦長代理となる。
クリンゴン人であるが、幼少の頃にロミュランの攻撃で両親と死別し、地球人科学者の夫妻に助けられ、養子として育てられる。
マイケル・ドーン Michael Dorn
マイルズ・エドワード・オブライエン
Chief O'Brien
地球のアイルランド出身。
元U.S.S.エンタープライズD号（艦長：ピカード）転送主任。2369年よりDS9へ転属、技術部長となる。
DS9ではエンジニア不足のため常に忙しい。エンタープライズD号で知り合った植物学者ケイコ・イシカワと結婚、一人娘モリーがいる。
コルム・ミーニー Colm Meaney
ジュリアン・ベシアー
Doctor Jules "Julian" Subatoi Bashir
地球人。DS9医療主任。宇宙艦隊中尉。
オープンで惚れっぽいが友人も多い。ジャッジアを口説いたことがあるが失敗。
意外と努力家で、医者としての経験の若さを補う。
演じるシディグはスーダン人の父とイギリス人の母を持つアラブ系の名家出身の俳優。実生活ではキラ役のナナ・ヴィジターとの間に息子がいる。
アレクサンダー・シディグ Alexander Siddig
クワーク
Quark.
フェレンギ人。DS9の唯一の飲食店「クワークのバー」の経営者でDS9に居住する民間人の代表的存在。
カーデシア管理時代よりカジノとバーを営んでおり、ステーション内部には詳しい。
フェレンギ社会では金儲けが美徳とされ、ラチナムという通貨を持つ。クワークもバーの経営にとどまらず、みやげものから兵器まであらゆるものを商売のタネとしている。