シーズン1　第1話「惑星M113の吸血獣」

The Man Trap

[シリーズ通算 #1]
エンタープライズ号は考古学者のクレイター夫妻に生活必需品を運ぶため惑星M113を訪れた。妻ナンシーは数年前ドクター・マッコイと恋仲だったが、再会してみると当時とまったく変わってしまっていることに気づく。実はナンシーはすでに異星人に殺されており、目の前のナンシーはその異星人が変身した姿だったのだ。

[オリジナル版日本初放送時　第3話]

シーズン1　第2話「セイサス星から来た少年」

Charlie X

[シリーズ通算 #2]
14年前に惑星セイサス14で遭難した少年ピーターをエンタープライズ号に引き渡した宇宙船アンタレス号は、その直後破壊されてしまった。ピーターは超能力を持っており、一目ぼれしたジェニーに鼻であしらわれると怒りを爆発させ、超能力でエンタープライズ号を占領してしまう。

[オリジナル版日本初放送時　第8話]

シーズン1　第3話「光るめだま」

Where No Man Has Gone Before

[シリーズ通算 #3]
地球連合政府所属の大型宇宙船エンタープライズ号は歴史に一頁をつけ加えるであろう任務を受ける。銀河を抜け出し、人類未踏の彼方の宇宙へ、探偵飛行を行うのだ。カーク船長指揮のもと、エンタープライズ号はこの画期的な飛行に飛び立つ。

飛行中、磁気嵐に遭遇。被害を受けながらも脱出するエンタープライズ号。しかしカークの友人ミッチェル少佐とデナー精神科医が意識を回復したとき、二人はすさまじい超能力を持った人間以外のなにかに変身してしまっていた。

[オリジナル版日本初放送時　第1話]

シーズン1　第4話「魔の宇宙病」

The Naked Time

[シリーズ通算 #4]
科学調査班のSOSを受け、惑星サイ2000に上陸したエンタープライズ号の乗員が奇妙な症状に罹り、他の乗員たちにも次々と感染し始める。この症状に感染したものは、アルコールか薬に酔っ払ったように自制心をなくしてしまうのだ。そして、症状の激しいライリーがエンジン・ルームへ入り込み、エンジンのスイッチを切ってしまい･･･。

[オリジナル版日本初放送時　第5話]

シーズン1　第5話「二人のカーク」

The Enemy Within

[シリーズ通算 #5]
エンタープライズ号は、惑星アルファ117で鉱石の標本を採集する。しかし持ち帰った鉱石が原因で転送装置の故障、カークは分身し二人になってしまう。一人は聡明で優しい「善」のカーク、もう一人は暴力的で野蛮な「悪」のカーク。船長が二人になってしまったことに気づいていない乗員たちは、突如暴言を吐き始めたカークに困惑させられる。

[オリジナル版日本初放送時　第7話]

シーズン1　第6話「恐怖のビーナス」

Mudd's Women

[シリーズ通算 #6]
エンタープライズ号は、正体不明の小型宇宙船を追跡する。しかし相手が遭難したため、その乗組員である3人の美女を引き連れたペテン師ハリー･マッドを救出する。しかしこの救出でエンタープライズ号は船に必要なディリチウム水晶を焼ききってしまい、採鉱惑星に向かうことになる。

[オリジナル版日本初放送時　第13話]

シーズン1　第7話「コンピューター人間」

What Are Little Girls Made Of?

[シリーズ通算 #7]
コービー博士の生死を確かめるため惑星エクソ3に向かうエンタープライズ号。惑星に接近したカークは、ついに奇跡的にコービー博士との交信に成功、博士が生存していることを知る。コービー博士の婚約者で彼を捜索するために地上勤務を辞めエンタープライズ号に乗り込んでいた看護師のチャペルはカークと共に惑星に上陸する。

[オリジナル版日本初放送時　第4話]

シーズン1　第8話「４００才の少女」

Miri

[シリーズ通算 #8]
エンタープライズ号が到着したある惑星では大人たちが奇病にかかって死に絶え、生命延長計画の実験で100年も生き延びた「子供たち」だけが住んでいた。カークたち上陸班もこの奇病にかかってしまい、マッコイが解毒薬を見つけ出そうと努力するが、大人を信じていない「子供たち」は彼らを妨害する。

[オリジナル版日本初放送時　第9話]

シーズン1　第9話「悪魔島から来た男」

Dagger of the Mind

[シリーズ通算 #9]
エンタープライズ号に犯罪者植民地である惑星タンタルス5から被収容者が逃げ込んできた。錯乱したこの患者はタンタルス5を管理するアダムズ博士の助手ゲルダー博士であると判明する。男はしきりに、フィモ植民星、通称悪魔島へ連れ戻さないでくれと懇願する。そこでカークと精神病の女医ヘレンが調査のために悪魔島に向かうが・・・。

[オリジナル版日本初放送時　第17話]

シーズン1　第10話「謎の球体」

The Corbomite Maneuver

[シリーズ通算 #10]
エンタープライズ号は突如巨大な球形の宇宙船フェザリウスに追い詰められる。司令官ベイロックは10分後にエンタープライズ号を破壊すると通告。カークはハッタリで、エンタープライズ号は「コーボマイト」という自爆システムを備えていて爆破すれば攻撃者も同時に破壊されると応戦する。

[オリジナル版日本初放送時　第2話]

シーズン1　第11話「タロス星の幻怪人　シーズン1　第1部」

The Menagerie, Part I

[シリーズ通算 #11]
エンタープライズ号は、宇宙基地M11から寄港の要請を受けて急行するが、そこにいたのはあわれな姿の前エンタープライズ船長、パイク大佐だった。そんな中、スポックはエンタープライズをのっとり、現在では接近すら禁じられている謎の惑星タロスへ進路をとる。実はパイク大佐は以前タロス星に近づいたことがあり･･･。

[オリジナル版日本初放送時　第25話]

シーズン1　第12話「タロス星の幻怪人　シーズン1　第2部」

The Menagerie, Part II

[シリーズ通算 #12]
タロスへの進路をとったスポックは軍法会議にかけられる。そこで明かされる13年前の真実。タロス星人は精神力が発達し超能力を備えていたが、技術面がおとり、当時のパイク船長とある女を結婚させ、子供を生ませて人間を作り出そうとしていたのだった・・・。

[オリジナル版日本初放送時　第26話]

シーズン1　第13話「殺人鬼コドス」

The Conscience of the King

[シリーズ通算 #13]
エンタープライズは天才的科学者レイトン博士のいる植民星シグニア・マイナーに向かう。実はレイトンとカークの家族は20年前にコドスという殺人鬼に殺害されており、俳優アントン・カリディアンが実は凶悪犯コドスではないかと疑い、カークを呼び寄せ正体を見極めようとしていたのだ。しかし博士も何者かに殺されてしまい･･･。

[オリジナル版日本初放送時　第11話]

シーズン1　第14話「宇宙基地ＳＯＳ」

Balance of Terror

[シリーズ通算 #14]
ロミュラン帝国との境界にある中立宙域を調査中のエンタープライズ号に、地球植民地がロミュラン帝国の攻撃を受けているという報告が入る。ロミュラン帝国はなんと地球制服をたくらんでいたのだった。宇宙船の姿を消す遮蔽装置を完成させていたロミュラン帝国に苦戦を強いられるエンタープライズ号だが・・・。

[オリジナル版日本初放送時　第6話]

シーズン1　第15話「おかしなおかしな遊園惑星」

Shore Leave

[シリーズ通算 #15]
3ヶ月の激務を終えたカークたちは、全員に休暇を与えるため、ある惑星に接近し、調査班を上陸させる。ところが、調査班の一員だったドクターが「不思議の国のアリス」に出てくるような兎と女の子を見たため、カークが降りて安全を確認することに。やがてカークは、仕官学校時代の上級生フィネガンに逢い、そのあとで15年前の恋人にも出逢い・・・。

[オリジナル版日本初放送時　第27話]

シーズン1　第16話「ゴリラの惑星」

The Galileo Seven

[シリーズ通算 #16]
植民地ニューパリで伝染病が猛威をふるい、エンタープライズ号は緊急医薬品をマーカス3番星まで運ぶ任務につく。その途中、ムラサキ312として知られる科学現象に遭遇、スポックとドクターが宇宙艇ガリレオで調査に向かう。しかしムラサキに近づいたとたんに計器が故障、トーラスに不時着、しかもエンタープライズとの連絡も不可能になってしまう。

[オリジナル版日本初放送時　第10話]

シーズン1　第17話「ゴトス星の怪人」

The Squire of Gothos

[シリーズ通算 #17]
ベータ6植物星へ補給物資を運ぶ途中、エンタープライズはある太陽系で不思議な惑星を発見。しかも傍を通過しようとした時、加藤と船長の姿が突如消えてしまう。何者かの仕業でこの謎の惑星に転送されたに違いないと思うスポックは、ドクターたちを捜索隊として派遣するが・・・。

[オリジナル版日本初放送時　第22話]

シーズン1　第18話「怪獣ゴーンとの対決」

Arena

[シリーズ通算 #18]
エンタープライズは、地球の最前哨基地があるセスタス3号星の要請を受け、基地へ向かう。ところが基地はすでに完全に破壊され、カークたちも何者かに激しい攻撃を受ける。敵船を追っていくと突然謎の光線で船が静止させられる。謎の光線を発していたメトロンは、自分たちの領域に進入した二隻の船の船長に決闘することを求める。

[オリジナル版日本初放送時　第12話]

シーズン1　第19話「宇宙暦元年7.21」

Tomorrow is Yesterday

[シリーズ通算 #19]
エンタープライズ号は、宇宙飛行中にブラックスターに遭遇。その引力から逃れるために全動力を起動させるがバランスを失い叩きつけられてしまい、なんと400年前、1960年代に戻ってしまう。一方、エンタープライズが接近するのをキャッチした地球のアメリカ空軍は、正体不明の飛行物体として、クリストファー大佐のジェット機に追跡、確認を命じる。

[オリジナル版日本初放送時　第14話]

シーズン1　第20話「宇宙軍法会議」

Court Martial

[シリーズ通算 #20]
エンタープライズ号は、パトロール中激しいイオン嵐に遭遇し、船体にかなりの被害を受け、犠牲者1名を出す。補修作業のためシーズン1　第１１宇宙基地に寄航、事件を報告するカーク船長。報告として提出したコンミューター日誌に意外な事実が記されており、犠牲者を出したことへのカークの責任問題で軍法会議が開かれることに。

[オリジナル版日本初放送時　第16話]

シーズン1　第21話「ベータ・スリーの独裁者」

The Return of the Archons

[シリーズ通算 #21]
100年前に行方不明となったパトロール艦アーコン号の手がかりを探すため、エンタープライズは惑星ベータ3に接近して、ミスター加藤とオニールが偵察班として上陸。だがミスター加藤は、人が変わったような異常な心理状態で戻ってくる。実はこの惑星はランドルーなる絶対の権力者の支配下にあった。しかしランドルーの正体は・・・

[オリジナル版日本初放送時　第24話]

シーズン1　第22話「宇宙の帝王」

Space Seed

[シリーズ通算 #22]
エンタープライズは宇宙をパトロール中、地球の古い宇宙船に遭遇。その船にはなんと20世紀の人間が80名近くも人工冬眠器に入って眠り続けていた。スポックの調査により、彼らは人為的に作り出された、優生人間であることが判明。しかも何かの影響で、その中の1人、リーダー、カンと名乗る男が目覚め･･･。

[オリジナル版日本初放送時　第15話]

シーズン1　第23話「コンピューター戦争」

A Taste of Armageddon

[シリーズ通算 #23]
宇宙の一角にある惑星エミニア7へ向かうエンタープライズ号。船内には、エミニアと条約を結び、そこへ条約港を設けるという任務を帯びたフォックス大使が来ていた。エミニア7は、隣接する惑星ベンディカーと戦争していたのだが、これは奇怪なコンピューター戦争とも呼ばれるべきものだった・・・。

[オリジナル版日本初放送時　第19話]

シーズン1　第24話「死の楽園」

This Side of Paradise

[シリーズ通算 #24]
バーソルド光線の照射を受け、全員死亡したとみられているオミクロン・ケティ3番星だったが、そこにはなんと住人たちがいた。死の光線を受けても完全な健康で生きている彼らの謎を解明しようとするカークたち。やがて、開拓者全員を宇宙基地へ撤去させようとするが、彼らはそれを拒否、しかもスポックまで彼らの味方をするようになり・・・。

[オリジナル版日本初放送時　第21話]

シーズン1　第25話「地底怪獣ホルタ」

The Devil in the Dark

[シリーズ通算 #25]
惑星ジェナス6から緊急連絡を受けたエンタープライズ号。ジェナス6の地下坑道に怪物が現れ、機械や人間を次々と犠牲にしていくと云うのだ。怪物は原子炉の循環ポンプを奪い去り、このままでは惑星は放射能に汚染されてしまう。このためカークは、チャーリーに命じて補助ポンプを作らせるが・・・。

[オリジナル版日本初放送時　第20話]

シーズン1　第26話「クリンゴン帝国の侵略」

Errand of Mercy

[シリーズ通算 #26]
地球が属する惑星連邦と、クリンゴン帝国の平和交渉が決裂し、ついに全面戦争に入る。カークたちは宇宙艦隊総司令部の命令で、戦略上のキーポイント、惑星オルガニアに急行する。連邦に協力するよう申し出るカークたちだが、長老たちは平静そのもの。やがてクリンゴン艦隊が来襲し侵略するが・・・。

[オリジナル版日本初放送時　第29話]

シーズン1　第27話「二つの宇宙」

The Alternative Factor

[シリーズ通算 #27]
エンタープライズは強烈な衝撃を受ける。原因不明の謎のショックで、全宇宙が影響を受けたらしい。カークたちは戦闘配置について、衝撃の源と思われる惑星を調査する。だがそこで発見したのは、小さな宇宙艇と、ラザラスと名乗る地球人と全く同じの一人の男だった。だが実は、ラザラスと全く同じ人間がもう1人いた･･･。

[オリジナル版日本初放送時　第18話]

シーズン1　第28話「危険な過去への旅」

The City on the Edge of Forever

[シリーズ通算 #28]
エンタープライズは、何百万キロ彼方の宇宙から、時間に歪みを与える障害波が出ているのをキャッチし、その原因調査に急行する。一方、劇薬コルドラジンを、誤って自分に注射してしまドクターは発狂し、カークたちが自分を殺そうとしていると思い、惑星上に逃げてしまう。カークたちは至急ドクターを追って問題の惑星に降りるが･･･。

[オリジナル版日本初放送時　第23話]

シーズン1　第29話「デネバ星の怪奇生物」

Operation: Annihilate!

[シリーズ通算 #29]
得体の知れない集団精神異常現象が起こり、文明が破壊されてしまう事件を調査するため、惑星デネバへ向かう。だが時すでに遅く、デネバの100万人は謎の宇宙生物の犠牲者となり、カークの兄一家も少年ピーターを残して死んでしまっていた。しかもスポックがこの謎の生物の攻撃を受けて犠牲者に・・・。

[オリジナル版日本初放送時　第28話]