第1話 頭脳変換機ビッグラット

THE MOST SPECIAL AGENT

世界的な電子工学博士イアン・マックレイン教授が3年がかりで完成させた頭脳変換機ビッグラット。それは一個人の脳波パターンを検出して記録し、その知識と経験を他人に移し変えることのできる装置だ。教授の親友であるサムの紹介により、ビッグラットはサムの所属する世界諜報連絡機構WINロンドン支局のために使用されることとなった。そして教授の養子で9歳の少年ジョーをコードネーム「ジョー90」として特別諜報部員として参加させる。彼の最初の任務はロシアの最新鋭戦闘機ミグ242の奪取である。

第2話 地底基地を爆破せよ

HI-JACKED

敵に襲われた諜報部員エド・ジョンソンの能力を授けられたジョーは、兵器庫から出発したトラックに積まれた銃火器の木箱に入り、襲撃してくる武器密輸団のマリオ・カリテの隠れ家を突き止めることとなった。軍の武器を奪い転売するカリテ一味の地底基地に侵入したジョーだったが、発見されて危機におちいってしまう。

第3話 宇宙ステーション応答せよ

MOST SPECIAL ASTRONAUT

WINレーダーの中心となる宇宙ステーションに、空気と資材を届ける物資補給ロケットの打ち上げが失敗した。ステーションに空気を届けるため、宇宙飛行士の能力を与えられたジョーの乗る補給ロケット2号が打ち上げられる。

第4話 世界征服計画を破壊しろ

BUSINESS HOLIDAY

ベネリータ国では革命政府が世界陸軍の部隊を撤退させ、基地を占拠した。軍備の強化を計画する革命政府に危機を感じるWINだったが、サムの出動要請を教授親子は拒否して、休暇を過ごすボローバへ出発してしまった。

第5話 北海のミサイル回収

ARCTIC ADVENTURE

核爆弾を4基搭載する世界空軍のXB-107型爆撃機が、計器類の故障によりバタリア国国境近く、ボスチュラ海底基地付近の北極海に墜落した。核爆弾の３基は公海上の海底から無事回収されたが、のこる１基が行方不明となってしまう。北極海に詳しいケルヴァン博士の能力を与えられたジョーは、核爆弾回収のために小型潜水艇に乗り込んだ。しかしバタリア国ボスチュラ海底基地からも攻撃潜水艦が出動し…。

第6話 連続ジェット機墜落の謎

SPLASH DOWN

スタンブール行きの科学者が行方不明となる旅客機墜落事故が続発した。サムは、空軍パイロットの能力を得たジョーとマックレイン教授がおとりになって問題のイスタンブール行きCV9型中距離旅客機に搭乗し、犯人を罠にかける作戦を実行。誘拐団のクレーマーに麻酔銃で撃たれ気絶したパイロットに代わって機を操縦するジョーは、誘拐団の船を追跡する。

第7話 恐怖の海底脱出

THE BIG FISH

魚雷テスト中の二人乗り世界海軍小型原子力潜水艦U85が、発射管の故障で独裁国家ポルトグアナ海域で沈没した。マックレイン教授と海底探検家の能力を得たジョーは、夜釣りに扮して回収に出発する。

第8話 消えた天才ピアニスト

INTERNATIONAL CONCERTO

天才ピアノ演奏家イゴール・スラディックは、東欧の演奏ツアー中、盗聴した軍事情報を暗号文でWINに伝えていた。だが彼を疑う情報部に逮捕されてしまい、マックレイン教授とジョーが救出に向かう。

第9話 ジャングル死の脱出

THE FORTRESS

南米サンタマリナで諜報員ロジャー・フレミングが捕まった。負傷しながらも脱出した諜報員ララミーの能力を得たジョーは、隠された情報マイクロ・フィルムの回収とフレミングの救出に出発する。

第10話 二重スパイは誰だ

DOUBLE AGENT

テヘランに運ぶWIN新暗号簿と解読テープが連続して狙われた。この任務はWINの幹部スローンの能力を得たジョーに託される。しかしジョーはなぜかパリへと向かった…。

第11話 地獄の生き埋め

RELATIVE DANGER

ウラニウム鉱調査中の老地質学者と二人の物理学者が、ブエブロ鉱山で生き埋めとなる。ウェストン局長の命令でサムとマックレイン教授、ジョーが現場に向かう。老地質学者はサムの父ウィリーだったのだ。

第12話 決死のスピードレース

THE RACE

世界陸軍情報部のテンペスト将軍が、WINを吸収合併すると宣言してウェストン局長と言い合いになり、いずれの組織が優秀かを証明するため、モンテカルロまでのスピードレースが提案される。スピードレースで決めることとなる。WIN側はマックレイン教授とジョーの乗るマックスカー、陸軍側は陸軍一の名ドライバー、クルーニー二等兵の乗るU87高速装甲車。テンペスト将軍はあらゆる不正をしてマックスカーを妨害する。果たして勝つのはどっちだ！？

第13話 幽霊教会の対決

THE UNORTHODOX SHEPHERD

幽霊が出るとの噂のある教会で、シェファード神父の話を聞くマックレイン教授とジョー。ジョーは世界銀行紙幣調査員の能力を得て、付近で出回る巧妙な偽ドル札の調査に訪れていた。

第14話 世界一の金庫破り

THE PROFESSIONAL

クレーマー財団から借款した病院建設援助の残り800万ドルの金塊で、不当に反乱鎮圧兵器スパイダー戦車の開発をするハペル将軍。その阻止のため、サムとマックレイン教授は服役中の金庫破りのプロ、ヘンリーの能力をジョーに与えた。ジョーはハペル将軍の難攻不落のランダル城から800万ドルの金塊を奪還すべく潜入を開始する。

第15話 ビッグラットの秘密を盗め

PROJECT 90

アルプス山頂の診療所を隠れ家にする国際ギャング団のダロタとカーソンは、WINの極秘事項「９０」を盗聴器で探り始め、ビッグラットの秘密を暴こうとマックレイン教授を誘拐してしまう。

第16話 大手術作戦

OPERATION McCLAINE

世界的な作家エストランの脳手術をするケイドス博士が、飛行機事故に遭ってしまう。作家を救おうと相談したが、秘密保持のためサムに反対されたマックレイン教授は…。

第17話 身代わり王子

KING FOR A DAY

アルダージ国のサルタン王が革新派の摂政セザールに暗殺され、英国留学中のカシム王子も配下に誘拐された。王子と瓜二つのジョーは教育係の頭脳を与えられ、継承式まで王子の代わりとなることに。

第18話 死のテストパイロット

TALK DOWN

テスト中の新型超音速戦闘機F116試作1号機が着陸直前で原因不明の墜落をした。重傷を負ったテストパイロット、グラントの脳波を記録、能力を得たジョーが公開飛行の2号機の搭乗、再度テストを開始することとなったが…。

第19話 早射ち保安官

LONE-HANDED 90

第20話 戦慄の脱獄囚

BREAK OUT

第21話 細菌爆弾X−41

MISSION X-14

第22話 海上大爆発

TRIAL AT SEA

第23話 タイガー作戦紛糾

ATTACK OF THE TIGER

第24話 恐怖の爆薬トラック

COLONEL McCLAINE

第25話 裏切りのテスト飛行

TEST FLIGHT

第26話 危険な女スパイ

THREE'S A CROWD

第27話 愉快なまぼろし作戦

SEE YOU DOWN THERE

第28話 魔神（ビラギラの呪い）

CHILD OF THE SUN-GOD

第29話 世界一のボディガード

VIVA CORDOVA

第30話 すばらしい誕生日

THE BIRTHDAY